管轶新论文:马来穿山甲是新冠中间宿主?

作者:PaperPP  发布时间:2020-02-20 18:33:19

2月18日,管轶教授在预印本论文库BioRxiv上,刊登了新论文,对中国南部马来半岛穿山甲中2019-nCoV相关冠状病毒的鉴定。

管轶新论文:马来穿山甲是新冠中间宿主?

不厌其烦的强调,预印版文章未经同行评议,未经过全世界相关领域专家的把关,结论不一定可靠。

是马来穿山甲不是中华穿山甲

本篇论文的研究的穿山甲有两批,分别来自广西和广东。

第一批是2017年8月至2018年1月间,来自广西海关对象为在日常反走私行动中查获的18株马来穿山甲的一共43个冷冻组织样本。

高通量测序揭示了43个样本中的六个(两个肺,两个肠,一个肺肠混合物,一个血液)中存在冠状病毒(冠状病毒可以细分为很多种,比如这次的新冠病毒只是其中一种)。

第二批来自广东海关在2018年5月至7月之间执法过程中存档的5个样本。2019年对这批样本高通量测序之后,发现含有冠状病毒读段。

同时也可以知道,两次检测的都不是中国本土的中华穿山甲,而是来自执法缴获的走私马来穿山甲。这一点,和华南农业大学在发布会上的信息一致。

以前的研究也没有发现中华穿山甲上带有致病冠状病毒。这对寻找这次病毒的真凶很有意义。

通过对这些样本的分析,能够获得部分基因序列,这些穿山甲冠状病毒基因组与2019-nCoV有高度相似性,大约85.5%至92.4%之间。

马来甲病毒和新冠病毒高度相似

通过对两批马来穿山甲样本中检出病毒的分析,研究团队画出了下图系统演化树。

图片中文标注来自@黑鱼周cnWATERS ,图中的爪哇穿山甲就是马来穿山甲。

管轶新论文:马来穿山甲是新冠中间宿主?

马来穿山甲一般指马来亚穿山甲,食物以白蚁为主,兼食黑蚁及蚁的幼虫。分布于印度尼西亚、老挝、马来西亚、缅甸、新加坡、泰国和越南等国。中国不分布。引自百度百科

广东和广西马来甲样本中检出病毒,分别落在致疫新冠病毒相关的演化支系内的两个亚谱系中,其中广东样本更为接近这次的2019-nCOV,但是,还是不如中菊头蝠的一个样本近。

病毒的受体结合域与病毒的传播性高度相关。在这个区域内,广东穿山甲样本和2019-nCoV有97.4%氨基酸相似性,高于蝙蝠样本的89.2%。

迄今为止,穿山甲是除蝙蝠以外唯一被2019-nCoV相关冠状病毒感染的哺乳动物。它是如何获得2019-nCOV 变异文章认为有两种可能:

1. 马来穿山甲病毒和蝙蝠病毒相遇并且重组出了致疫病毒;

2. 马来穿山甲病毒和2019-nCoV受体结合域的相似,是选择性介导的趋同演化,而不是重组引起的。

论文作者更倾向于后者,但他表示以目前的证据,确定哪一种推论更准确还需要进一步调查。

穿山甲真的就是直接中间宿主?

介于两批来源不同的马来甲样本中,都检出了相似的病毒,并且都和2019-nCOV病毒的关系非常近。

但是,样本中的病毒和2019-nCOV病毒还是有一定差异,并且整体的关系不如蝙蝠样本中检出的病毒,因此目前还不能确认马来甲就是2019-nCOV的直接中间宿主。

同时,文章也提到,两批马来穿山甲样本都来自东南亚走私的个体,但对这种动物在其本土地区所维持的病毒多样性的认识十分缺乏,还需要更多的病毒学分析。

我们该如何面对穿山甲

首先,应更强硬的打击针对穿山甲的盗猎和走私,无论是国内还是国外的品种。

其次,请不要野外放生任何缴获的走私马来穿山甲,因为他们:

1. 没有做来源鉴定;

2. 未做隔离检疫;

3. 未经过康复救助和野化训练。

其中第二条,就是害怕外来的马来甲体内带有病原体,可能伤害本土物种。甚至强到影响中国如此之大。

此次检出相似病毒的广西样本,在此前就有过鉴定,在其中发现有高致病性病毒。

然而,这个结论长期被某组织污蔑为“编造”。

该组织还长期致力于在中国放生马来穿山甲。

参考资料:

Identification of 2019-nCoV related coronaviruses in Malayan pangolins in

southern China. Tommy Tsan-Yuk Lam. bioRxiv 2020.02.13.945485

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